Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDG4

SCRN3, Secernin-3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN3Q0VDG4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCRN3Q0VDG4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCRN3Q0VDG4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms