Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms