Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFFO1Q0D2I5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms