Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms