Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms