Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms