Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPOCK1Q08629 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms