Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms