Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHX9Q08211 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms