Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CACNG1Q06432 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms