Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
EXOSC9Q06265 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms