Protein–RNA interactions for Protein: Q06106

MRD1, Multiple RNA-binding domain-containing protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRD1	Q06106	YGR161W-C	YGR161W-C	279 nt		4.11	□□□□□ -1.75
MRD1	Q06106	MRPS17	YMR188C	714 nt		4.11	□□□□□ -1.75
MRD1	Q06106	BAG7	YOR134W	1230 nt		4.11	□□□□□ -1.75
MRD1	Q06106	RPN8	YOR261C	1017 nt		4.11	□□□□□ -1.75
MRD1	Q06106	AVT7	YIL088C	1473 nt		4.11	□□□□□ -1.75
MRD1	Q06106	CHD1	YER164W	4407 nt		4.1	□□□□□ -1.75
MRD1	Q06106	HAP4	YKL109W	1665 nt		4.1	□□□□□ -1.75
MRD1	Q06106	RTS1	YOR014W	2274 nt		4.1	□□□□□ -1.75
MRD1	Q06106	FMP10	YER182W	735 nt		4.1	□□□□□ -1.75
MRD1	Q06106	FMP32	YFL046W	624 nt		4.1	□□□□□ -1.75
MRD1	Q06106	GTF1	YGR102C	552 nt		4.1	□□□□□ -1.75
MRD1	Q06106	SOP4	YJL192C	705 nt		4.1	□□□□□ -1.75
MRD1	Q06106	SIC1	YLR079W	855 nt		4.1	□□□□□ -1.75
MRD1	Q06106	YPT7	YML001W	627 nt		4.1	□□□□□ -1.75
MRD1	Q06106	POP8	YBL018C	402 nt		4.1	□□□□□ -1.75
MRD1	Q06106	RPS10B	YMR230W	318 nt		4.1	□□□□□ -1.75
MRD1	Q06106	CLG1	YGL215W	1359 nt		4.1	□□□□□ -1.75
MRD1	Q06106	SWH1	YAR042W	3567 nt		4.1	□□□□□ -1.75
MRD1	Q06106	DHR2	YKL078W	2208 nt		4.1	□□□□□ -1.75
MRD1	Q06106	TAF6	YGL112C	1551 nt		4.1	□□□□□ -1.75
MRD1	Q06106	RRN6	YBL014C	2685 nt		4.09	□□□□□ -1.75
MRD1	Q06106	VAC17	YCL063W	1272 nt		4.09	□□□□□ -1.75
MRD1	Q06106	TRX3	YCR083W	384 nt		4.09	□□□□□ -1.75
MRD1	Q06106	MTC3	YGL226W	372 nt		4.09	□□□□□ -1.75
MRD1	Q06106	YHR022C	YHR022C	771 nt		4.09	□□□□□ -1.75
MRD1	Q06106	GEP4	YHR100C	558 nt		4.09	□□□□□ -1.75
MRD1	Q06106	AUR1	YKL004W	1206 nt		4.09	□□□□□ -1.75
MRD1	Q06106	ECM16	YMR128W	3804 nt		4.09	□□□□□ -1.75
MRD1	Q06106	VAM3	YOR106W	852 nt		4.09	□□□□□ -1.75
MRD1	Q06106	YOR114W	YOR114W	885 nt		4.09	□□□□□ -1.75
MRD1	Q06106	RFM1	YOR279C	933 nt		4.09	□□□□□ -1.75
MRD1	Q06106	POL1	YNL102W	4407 nt		4.09	□□□□□ -1.75
MRD1	Q06106	ALO1	YML086C	1581 nt		4.09	□□□□□ -1.75
MRD1	Q06106	ROK1	YGL171W	1695 nt		4.09	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	snR78	snR78	87 nt		4.08	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	PST1	YDR055W	1335 nt		4.08	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	RNH202	YDR279W	1053 nt		4.08	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	UBX5	YDR330W	1503 nt		4.08	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	SER3	YER081W	1410 nt		4.08	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	RAD4	YER162C	2265 nt		4.08	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	AIM14	YGL160W	1713 nt		4.08	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	SOL3	YHR163W	750 nt		4.08	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	PTM1	YKL039W	1572 nt		4.08	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	YLR428C	YLR428C	345 nt		4.08	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	PPZ1	YML016C	2079 nt		4.08	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	MRPS8	YMR158W	468 nt		4.08	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	YBL096C	YBL096C	309 nt		4.08	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	PRS5	YOL061W	1491 nt		4.08	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	YBR103C-A	YBR103C-A	144 nt		4.08	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	SLA1	YBL007C	3735 nt		4.07	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	KTR6	YPL053C	1341 nt		4.07	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	RDI1	YDL135C	609 nt		4.07	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	YGR168C	YGR168C	1131 nt		4.07	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	YAL065C	YAL065C	387 nt		4.07	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	SED5	YLR026C	1023 nt		4.07	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	YOL019W-A	YOL019W-A	153 nt		4.07	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	PSF3	YOL146W	585 nt		4.07	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	EMC1	YCL045C	2283 nt		4.07	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	SWI1	YPL016W	3945 nt		4.06	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	CMK1	YFR014C	1341 nt		4.06	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	TRP4	YDR354W	1143 nt		4.06	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	PAN5	YHR063C	1140 nt		4.06	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	ATG16	YMR159C	453 nt		4.06	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	EAF7	YNL136W	1278 nt		4.06	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	PNG1	YPL096W	1092 nt		4.06	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	YBR137W	YBR137W	540 nt		4.06	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	RPS9B	YBR189W	588 nt		4.06	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	SPT6	YGR116W	4356 nt		4.05	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	FAD1	YDL045C	921 nt		4.05	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	NOP6	YDL213C	678 nt		4.05	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	RPC11	YDR045C	333 nt		4.05	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	RPA14	YDR156W	414 nt		4.05	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	ARI1	YGL157W	1044 nt		4.05	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	ERV29	YGR284C	933 nt		4.05	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	MYO3	YKL129C	3819 nt		4.05	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	MOH1	YBL049W	417 nt		4.05	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	SCD6	YPR129W	1050 nt		4.05	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	FYV5	YCL058C	459 nt		4.05	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	VPS27	YNR006W	1869 nt		4.05	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	XRS2	YDR369C	2565 nt		4.05	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	DBP5	YOR046C	1449 nt		4.04	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	RAD26	YJR035W	3258 nt		4.04	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	YCR024C-B	YCR024C-B	267 nt		4.04	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	YDR090C	YDR090C	933 nt		4.04	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	CAB2	YIL083C	1098 nt		4.04	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	AIM22	YJL046W	1230 nt		4.04	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	REE1	YJL217W	597 nt		4.04	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	YLR311C	YLR311C	348 nt		4.04	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	MTG1	YMR097C	1104 nt		4.04	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	PLP2	YOR281C	861 nt		4.04	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	PET20	YPL159C	762 nt		4.04	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	ATG29	YPL166W	642 nt		4.04	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	CHK1	YBR274W	1584 nt		4.04	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	YVC1	YOR087W	2028 nt		4.04	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	CEX1	YOR112W	2286 nt		4.04	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	GLC3	YEL011W	2115 nt		4.03	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	MTH1	YDR277C	1302 nt		4.03	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	HIM1	YDR317W	1245 nt		4.03	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	YER138W-A	YER138W-A	105 nt		4.03	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	SEC53	YFL045C	765 nt		4.03	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.2 ms