Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEUP1Q05D60 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEUP1Q05D60 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEUP1Q05D60 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DEUP1Q05D60 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEUP1Q05D60 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEUP1Q05D60 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEUP1Q05D60 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEUP1Q05D60 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEUP1Q05D60 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEUP1Q05D60 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEUP1Q05D60 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEUP1Q05D60 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEUP1Q05D60 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DEUP1Q05D60 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DEUP1Q05D60 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DEUP1Q05D60 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DEUP1Q05D60 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DEUP1Q05D60 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DEUP1Q05D60 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DEUP1Q05D60 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DEUP1Q05D60 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DEUP1Q05D60 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DEUP1Q05D60 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DEUP1Q05D60 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DEUP1Q05D60 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DEUP1Q05D60 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DEUP1Q05D60 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEUP1Q05D60 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms