Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms