Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms