Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms