Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BNC1Q01954 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms