Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK3Q00526 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CDK3Q00526 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDK3Q00526 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CDK3Q00526 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CDK3Q00526 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CDK3Q00526 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDK3Q00526 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDK3Q00526 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CDK3Q00526 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDK3Q00526 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK3Q00526 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK3Q00526 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK3Q00526 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK3Q00526 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK3Q00526 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK3Q00526 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDK3Q00526 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK3Q00526 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK3Q00526 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK3Q00526 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK3Q00526 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK3Q00526 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK3Q00526 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDK3Q00526 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK3Q00526 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK3Q00526 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK3Q00526 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDK3Q00526 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK3Q00526 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK3Q00526 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK3Q00526 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK3Q00526 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK3Q00526 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK3Q00526 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK3Q00526 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK3Q00526 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK3Q00526 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK3Q00526 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK3Q00526 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK3Q00526 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK3Q00526 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK3Q00526 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDK3Q00526 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK3Q00526 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK3Q00526 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK3Q00526 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK3Q00526 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK3Q00526 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK3Q00526 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK3Q00526 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK3Q00526 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDK3Q00526 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK3Q00526 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDK3Q00526 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK3Q00526 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK3Q00526 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK3Q00526 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK3Q00526 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK3Q00526 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK3Q00526 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK3Q00526 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK3Q00526 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK3Q00526 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK3Q00526 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK3Q00526 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDK3Q00526 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDK3Q00526 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK3Q00526 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK3Q00526 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK3Q00526 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK3Q00526 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK3Q00526 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK3Q00526 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK3Q00526 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK3Q00526 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK3Q00526 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK3Q00526 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK3Q00526 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK3Q00526 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK3Q00526 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK3Q00526 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK3Q00526 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK3Q00526 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK3Q00526 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK3Q00526 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK3Q00526 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK3Q00526 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK3Q00526 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK3Q00526 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK3Q00526 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms