Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXC5Q00444 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms