Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITPNAQ00169 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITPNAQ00169 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITPNAQ00169 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITPNAQ00169 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITPNAQ00169 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITPNAQ00169 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITPNAQ00169 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITPNAQ00169 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITPNAQ00169 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITPNAQ00169 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITPNAQ00169 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITPNAQ00169 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITPNAQ00169 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITPNAQ00169 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PITPNAQ00169 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITPNAQ00169 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITPNAQ00169 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PITPNAQ00169 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITPNAQ00169 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PITPNAQ00169 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms