Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKOR1P84550 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms