Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD3P84022 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMAD3P84022 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD3P84022 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms