Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBX1P83916 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBX1P83916 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBX1P83916 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBX1P83916 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBX1P83916 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBX1P83916 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBX1P83916 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBX1P83916 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBX1P83916 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBX1P83916 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBX1P83916 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBX1P83916 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBX1P83916 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBX1P83916 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBX1P83916 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBX1P83916 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBX1P83916 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX1P83916 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX1P83916 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX1P83916 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX1P83916 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX1P83916 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX1P83916 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX1P83916 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX1P83916 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX1P83916 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX1P83916 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX1P83916 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX1P83916 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX1P83916 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX1P83916 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX1P83916 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX1P83916 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX1P83916 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX1P83916 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX1P83916 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX1P83916 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX1P83916 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX1P83916 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX1P83916 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX1P83916 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX1P83916 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX1P83916 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX1P83916 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX1P83916 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX1P83916 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX1P83916 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX1P83916 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX1P83916 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX1P83916 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX1P83916 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX1P83916 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX1P83916 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX1P83916 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX1P83916 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX1P83916 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX1P83916 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX1P83916 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX1P83916 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX1P83916 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX1P83916 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX1P83916 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX1P83916 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX1P83916 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX1P83916 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX1P83916 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX1P83916 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX1P83916 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX1P83916 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX1P83916 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX1P83916 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX1P83916 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX1P83916 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX1P83916 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX1P83916 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX1P83916 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX1P83916 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX1P83916 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX1P83916 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX1P83916 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CBX1P83916 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX1P83916 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX1P83916 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX1P83916 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX1P83916 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX1P83916 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX1P83916 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX1P83916 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX1P83916 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX1P83916 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX1P83916 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX1P83916 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX1P83916 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX1P83916 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX1P83916 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX1P83916 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX1P83916 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX1P83916 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX1P83916 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms