Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUCB2P80303 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUCB2P80303 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NUCB2P80303 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUCB2P80303 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUCB2P80303 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUCB2P80303 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUCB2P80303 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUCB2P80303 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUCB2P80303 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NUCB2P80303 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUCB2P80303 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUCB2P80303 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUCB2P80303 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUCB2P80303 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUCB2P80303 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms