Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX4P78413 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX4P78413 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX4P78413 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX4P78413 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX4P78413 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX4P78413 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX4P78413 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX4P78413 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX4P78413 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX4P78413 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX4P78413 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX4P78413 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX4P78413 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX4P78413 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX4P78413 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX4P78413 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX4P78413 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX4P78413 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX4P78413 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX4P78413 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX4P78413 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRX4P78413 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX4P78413 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX4P78413 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX4P78413 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX4P78413 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX4P78413 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX4P78413 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX4P78413 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX4P78413 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX4P78413 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX4P78413 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX4P78413 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX4P78413 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX4P78413 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX4P78413 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX4P78413 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX4P78413 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX4P78413 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX4P78413 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX4P78413 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX4P78413 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX4P78413 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX4P78413 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX4P78413 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX4P78413 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX4P78413 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX4P78413 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX4P78413 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX4P78413 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX4P78413 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX4P78413 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX4P78413 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX4P78413 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX4P78413 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX4P78413 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX4P78413 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX4P78413 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX4P78413 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX4P78413 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX4P78413 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX4P78413 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX4P78413 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX4P78413 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX4P78413 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX4P78413 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX4P78413 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX4P78413 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX4P78413 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX4P78413 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX4P78413 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX4P78413 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX4P78413 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX4P78413 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX4P78413 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX4P78413 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX4P78413 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX4P78413 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX4P78413 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX4P78413 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX4P78413 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX4P78413 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX4P78413 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX4P78413 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX4P78413 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX4P78413 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX4P78413 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX4P78413 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX4P78413 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX4P78413 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX4P78413 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX4P78413 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX4P78413 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX4P78413 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX4P78413 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX4P78413 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX4P78413 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX4P78413 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX4P78413 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms