Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCNA1P78396 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms