Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PITX1P78337 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PITX1P78337 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PITX1P78337 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PITX1P78337 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PITX1P78337 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PITX1P78337 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PITX1P78337 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PITX1P78337 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PITX1P78337 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PITX1P78337 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PITX1P78337 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PITX1P78337 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PITX1P78337 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PITX1P78337 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PITX1P78337 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PITX1P78337 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PITX1P78337 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PITX1P78337 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PITX1P78337 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PITX1P78337 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PITX1P78337 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PITX1P78337 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PITX1P78337 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PITX1P78337 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PITX1P78337 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PITX1P78337 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PITX1P78337 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PITX1P78337 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PITX1P78337 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PITX1P78337 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PITX1P78337 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PITX1P78337 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PITX1P78337 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PITX1P78337 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PITX1P78337 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PITX1P78337 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PITX1P78337 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PITX1P78337 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PITX1P78337 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PITX1P78337 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PITX1P78337 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PITX1P78337 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PITX1P78337 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PITX1P78337 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PITX1P78337 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PITX1P78337 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PITX1P78337 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PITX1P78337 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PITX1P78337 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PITX1P78337 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PITX1P78337 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PITX1P78337 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PITX1P78337 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PITX1P78337 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PITX1P78337 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PITX1P78337 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PITX1P78337 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PITX1P78337 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PITX1P78337 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PITX1P78337 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PITX1P78337 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PITX1P78337 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PITX1P78337 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PITX1P78337 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PITX1P78337 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PITX1P78337 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PITX1P78337 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PITX1P78337 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PITX1P78337 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PITX1P78337 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PITX1P78337 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PITX1P78337 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PITX1P78337 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PITX1P78337 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PITX1P78337 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PITX1P78337 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PITX1P78337 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITX1P78337 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITX1P78337 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITX1P78337 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITX1P78337 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITX1P78337 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITX1P78337 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITX1P78337 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITX1P78337 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITX1P78337 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITX1P78337 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITX1P78337 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITX1P78337 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITX1P78337 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITX1P78337 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITX1P78337 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITX1P78337 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITX1P78337 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITX1P78337 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITX1P78337 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITX1P78337 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PITX1P78337 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITX1P78337 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms