Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA4AP68366 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA4AP68366 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA4AP68366 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA4AP68366 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA4AP68366 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA4AP68366 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA4AP68366 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA4AP68366 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA4AP68366 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA4AP68366 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA4AP68366 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA4AP68366 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA4AP68366 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA4AP68366 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA4AP68366 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA4AP68366 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA4AP68366 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA4AP68366 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA4AP68366 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA4AP68366 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA4AP68366 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA4AP68366 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA4AP68366 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA4AP68366 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA4AP68366 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA4AP68366 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA4AP68366 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA4AP68366 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA4AP68366 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA4AP68366 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA4AP68366 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA4AP68366 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA4AP68366 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA4AP68366 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA4AP68366 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA4AP68366 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA4AP68366 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA4AP68366 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA4AP68366 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms