Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP1S1P61966 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP1S1P61966 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP1S1P61966 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP1S1P61966 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP1S1P61966 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP1S1P61966 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP1S1P61966 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP1S1P61966 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP1S1P61966 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP1S1P61966 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP1S1P61966 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP1S1P61966 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP1S1P61966 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP1S1P61966 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP1S1P61966 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP1S1P61966 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP1S1P61966 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP1S1P61966 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP1S1P61966 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP1S1P61966 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AP1S1P61966 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP1S1P61966 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP1S1P61966 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AP1S1P61966 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AP1S1P61966 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP1S1P61966 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP1S1P61966 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP1S1P61966 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP1S1P61966 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP1S1P61966 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP1S1P61966 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP1S1P61966 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP1S1P61966 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP1S1P61966 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP1S1P61966 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP1S1P61966 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP1S1P61966 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP1S1P61966 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms