Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms