Protein–RNA interactions for Protein: P60842

EIF4A1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A1P60842 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EIF4A1P60842 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
EIF4A1P60842 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms