Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY3P57055 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY3P57055 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY3P57055 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY3P57055 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY3P57055 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY3P57055 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY3P57055 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY3P57055 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY3P57055 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY3P57055 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY3P57055 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY3P57055 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY3P57055 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY3P57055 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY3P57055 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY3P57055 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RIPPLY3P57055 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms