Protein–RNA interactions for Protein: P56559

ARL4C, ADP-ribosylation factor-like protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4CP56559 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARL4CP56559 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARL4CP56559 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARL4CP56559 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARL4CP56559 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARL4CP56559 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARL4CP56559 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms