Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATN1P54259 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATN1P54259 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATN1P54259 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATN1P54259 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATN1P54259 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATN1P54259 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATN1P54259 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATN1P54259 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATN1P54259 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATN1P54259 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATN1P54259 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATN1P54259 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATN1P54259 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATN1P54259 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATN1P54259 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATN1P54259 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATN1P54259 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATN1P54259 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATN1P54259 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATN1P54259 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATN1P54259 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATN1P54259 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATN1P54259 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATN1P54259 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATN1P54259 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATN1P54259 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATN1P54259 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATN1P54259 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATN1P54259 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATN1P54259 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATN1P54259 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATN1P54259 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATN1P54259 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATN1P54259 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATN1P54259 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATN1P54259 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATN1P54259 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATN1P54259 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATN1P54259 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATN1P54259 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATN1P54259 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATN1P54259 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATN1P54259 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATN1P54259 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATN1P54259 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATN1P54259 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATN1P54259 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATN1P54259 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATN1P54259 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATN1P54259 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATN1P54259 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATN1P54259 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATN1P54259 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATN1P54259 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATN1P54259 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATN1P54259 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATN1P54259 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATN1P54259 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATN1P54259 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATN1P54259 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATN1P54259 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATN1P54259 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATN1P54259 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATN1P54259 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATN1P54259 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATN1P54259 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATN1P54259 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATN1P54259 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATN1P54259 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATN1P54259 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATN1P54259 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATN1P54259 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATN1P54259 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATN1P54259 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATN1P54259 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATN1P54259 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATN1P54259 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATN1P54259 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATN1P54259 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATN1P54259 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATN1P54259 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATN1P54259 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATN1P54259 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATN1P54259 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATN1P54259 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATN1P54259 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATN1P54259 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATN1P54259 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATN1P54259 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATN1P54259 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATN1P54259 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATN1P54259 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATN1P54259 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATN1P54259 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATN1P54259 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATN1P54259 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATN1P54259 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATN1P54259 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATN1P54259 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms