Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms