Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LBX1P52954 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LBX1P52954 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LBX1P52954 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LBX1P52954 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LBX1P52954 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LBX1P52954 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LBX1P52954 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LBX1P52954 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LBX1P52954 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LBX1P52954 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LBX1P52954 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LBX1P52954 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LBX1P52954 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LBX1P52954 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LBX1P52954 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LBX1P52954 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LBX1P52954 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LBX1P52954 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LBX1P52954 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LBX1P52954 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LBX1P52954 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LBX1P52954 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LBX1P52954 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LBX1P52954 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LBX1P52954 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LBX1P52954 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LBX1P52954 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LBX1P52954 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LBX1P52954 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LBX1P52954 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LBX1P52954 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LBX1P52954 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LBX1P52954 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LBX1P52954 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LBX1P52954 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LBX1P52954 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LBX1P52954 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LBX1P52954 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LBX1P52954 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LBX1P52954 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LBX1P52954 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LBX1P52954 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LBX1P52954 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LBX1P52954 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LBX1P52954 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LBX1P52954 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LBX1P52954 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LBX1P52954 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LBX1P52954 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LBX1P52954 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LBX1P52954 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LBX1P52954 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LBX1P52954 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LBX1P52954 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LBX1P52954 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LBX1P52954 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LBX1P52954 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LBX1P52954 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LBX1P52954 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LBX1P52954 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LBX1P52954 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LBX1P52954 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LBX1P52954 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LBX1P52954 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LBX1P52954 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LBX1P52954 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LBX1P52954 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LBX1P52954 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LBX1P52954 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LBX1P52954 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LBX1P52954 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LBX1P52954 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LBX1P52954 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LBX1P52954 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LBX1P52954 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LBX1P52954 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LBX1P52954 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LBX1P52954 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LBX1P52954 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LBX1P52954 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LBX1P52954 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LBX1P52954 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LBX1P52954 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LBX1P52954 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LBX1P52954 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LBX1P52954 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LBX1P52954 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LBX1P52954 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LBX1P52954 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LBX1P52954 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LBX1P52954 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LBX1P52954 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LBX1P52954 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LBX1P52954 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LBX1P52954 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LBX1P52954 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LBX1P52954 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LBX1P52954 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LBX1P52954 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms