Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX2-5P52952 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX2-5P52952 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms