Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP98P52948 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP98P52948 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP98P52948 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP98P52948 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP98P52948 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP98P52948 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP98P52948 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP98P52948 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP98P52948 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP98P52948 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP98P52948 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP98P52948 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP98P52948 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP98P52948 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP98P52948 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP98P52948 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP98P52948 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP98P52948 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP98P52948 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP98P52948 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP98P52948 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP98P52948 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP98P52948 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP98P52948 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP98P52948 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP98P52948 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP98P52948 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP98P52948 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP98P52948 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP98P52948 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP98P52948 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP98P52948 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP98P52948 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP98P52948 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP98P52948 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP98P52948 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP98P52948 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP98P52948 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP98P52948 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP98P52948 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP98P52948 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP98P52948 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP98P52948 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NUP98P52948 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NUP98P52948 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NUP98P52948 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NUP98P52948 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NUP98P52948 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUP98P52948 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUP98P52948 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUP98P52948 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUP98P52948 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUP98P52948 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUP98P52948 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUP98P52948 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUP98P52948 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NUP98P52948 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUP98P52948 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP98P52948 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP98P52948 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP98P52948 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP98P52948 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP98P52948 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP98P52948 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP98P52948 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP98P52948 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP98P52948 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP98P52948 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP98P52948 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP98P52948 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP98P52948 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP98P52948 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP98P52948 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP98P52948 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP98P52948 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP98P52948 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP98P52948 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP98P52948 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP98P52948 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP98P52948 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP98P52948 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP98P52948 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP98P52948 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP98P52948 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP98P52948 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP98P52948 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP98P52948 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP98P52948 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP98P52948 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP98P52948 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP98P52948 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP98P52948 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP98P52948 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP98P52948 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP98P52948 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP98P52948 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP98P52948 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP98P52948 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP98P52948 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms