Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2A2P52657 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms