Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEK4P51957 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEK4P51957 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEK4P51957 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEK4P51957 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NEK4P51957 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEK4P51957 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEK4P51957 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEK4P51957 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NEK4P51957 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEK4P51957 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEK4P51957 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEK4P51957 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEK4P51957 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEK4P51957 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEK4P51957 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEK4P51957 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEK4P51957 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEK4P51957 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEK4P51957 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEK4P51957 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEK4P51957 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEK4P51957 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEK4P51957 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEK4P51957 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEK4P51957 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEK4P51957 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEK4P51957 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEK4P51957 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEK4P51957 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEK4P51957 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEK4P51957 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEK4P51957 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEK4P51957 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEK4P51957 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEK4P51957 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEK4P51957 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEK4P51957 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEK4P51957 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEK4P51957 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEK4P51957 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEK4P51957 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEK4P51957 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEK4P51957 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEK4P51957 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEK4P51957 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEK4P51957 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEK4P51957 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEK4P51957 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NEK4P51957 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEK4P51957 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NEK4P51957 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEK4P51957 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEK4P51957 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEK4P51957 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEK4P51957 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEK4P51957 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEK4P51957 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEK4P51957 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEK4P51957 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEK4P51957 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEK4P51957 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEK4P51957 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEK4P51957 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NEK4P51957 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEK4P51957 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEK4P51957 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEK4P51957 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEK4P51957 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEK4P51957 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEK4P51957 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NEK4P51957 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEK4P51957 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEK4P51957 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEK4P51957 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEK4P51957 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEK4P51957 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEK4P51957 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEK4P51957 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEK4P51957 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEK4P51957 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEK4P51957 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEK4P51957 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEK4P51957 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEK4P51957 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEK4P51957 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEK4P51957 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEK4P51957 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEK4P51957 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEK4P51957 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEK4P51957 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEK4P51957 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEK4P51957 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEK4P51957 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NEK4P51957 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEK4P51957 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEK4P51957 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEK4P51957 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEK4P51957 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEK4P51957 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms