Protein–RNA interactions for Protein: P51805

PLXNA3, Plexin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA3P51805 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PLXNA3P51805 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PLXNA3P51805 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXNA3P51805 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXNA3P51805 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXNA3P51805 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXNA3P51805 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXNA3P51805 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXNA3P51805 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXNA3P51805 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXNA3P51805 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXNA3P51805 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXNA3P51805 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXNA3P51805 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXNA3P51805 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXNA3P51805 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXNA3P51805 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXNA3P51805 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXNA3P51805 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXNA3P51805 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXNA3P51805 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNA3P51805 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNA3P51805 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNA3P51805 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNA3P51805 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNA3P51805 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNA3P51805 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNA3P51805 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNA3P51805 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNA3P51805 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNA3P51805 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms