Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCNKBP51801 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms