Protein–RNA interactions for Protein: P51168

SCNN1B, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1BP51168 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCNN1BP51168 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms