Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP1A2P50993 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP1A2P50993 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP1A2P50993 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP1A2P50993 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP1A2P50993 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP1A2P50993 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP1A2P50993 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP1A2P50993 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP1A2P50993 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP1A2P50993 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP1A2P50993 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP1A2P50993 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP1A2P50993 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP1A2P50993 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP1A2P50993 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP1A2P50993 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP1A2P50993 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP1A2P50993 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP1A2P50993 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP1A2P50993 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms