Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSEN2P49810 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms