Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK8P49336 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK8P49336 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK8P49336 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK8P49336 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK8P49336 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK8P49336 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK8P49336 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK8P49336 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK8P49336 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK8P49336 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK8P49336 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK8P49336 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK8P49336 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK8P49336 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK8P49336 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK8P49336 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK8P49336 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK8P49336 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK8P49336 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK8P49336 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK8P49336 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK8P49336 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK8P49336 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK8P49336 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK8P49336 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK8P49336 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK8P49336 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK8P49336 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK8P49336 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK8P49336 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDK8P49336 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK8P49336 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK8P49336 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK8P49336 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK8P49336 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK8P49336 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK8P49336 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK8P49336 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK8P49336 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK8P49336 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK8P49336 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK8P49336 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK8P49336 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK8P49336 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK8P49336 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK8P49336 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK8P49336 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK8P49336 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK8P49336 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK8P49336 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK8P49336 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK8P49336 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK8P49336 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK8P49336 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK8P49336 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK8P49336 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK8P49336 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK8P49336 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK8P49336 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK8P49336 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK8P49336 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK8P49336 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK8P49336 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK8P49336 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK8P49336 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK8P49336 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK8P49336 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK8P49336 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK8P49336 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK8P49336 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK8P49336 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK8P49336 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK8P49336 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK8P49336 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK8P49336 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK8P49336 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK8P49336 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK8P49336 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK8P49336 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK8P49336 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK8P49336 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK8P49336 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK8P49336 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK8P49336 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK8P49336 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK8P49336 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK8P49336 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK8P49336 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK8P49336 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK8P49336 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK8P49336 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK8P49336 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK8P49336 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK8P49336 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK8P49336 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK8P49336 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK8P49336 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK8P49336 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK8P49336 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms