Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCLCP48506 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCLCP48506 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GCLCP48506 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GCLCP48506 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GCLCP48506 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GCLCP48506 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCLCP48506 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GCLCP48506 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCLCP48506 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCLCP48506 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCLCP48506 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GCLCP48506 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCLCP48506 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GCLCP48506 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCLCP48506 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCLCP48506 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCLCP48506 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCLCP48506 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCLCP48506 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCLCP48506 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCLCP48506 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCLCP48506 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCLCP48506 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCLCP48506 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCLCP48506 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCLCP48506 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCLCP48506 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCLCP48506 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCLCP48506 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCLCP48506 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCLCP48506 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCLCP48506 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCLCP48506 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GCLCP48506 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GCLCP48506 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCLCP48506 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCLCP48506 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCLCP48506 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCLCP48506 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCLCP48506 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GCLCP48506 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCLCP48506 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCLCP48506 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCLCP48506 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCLCP48506 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCLCP48506 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCLCP48506 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCLCP48506 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCLCP48506 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GCLCP48506 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GCLCP48506 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCLCP48506 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCLCP48506 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCLCP48506 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCLCP48506 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCLCP48506 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCLCP48506 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCLCP48506 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCLCP48506 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCLCP48506 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCLCP48506 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCLCP48506 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCLCP48506 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GCLCP48506 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCLCP48506 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCLCP48506 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCLCP48506 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCLCP48506 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCLCP48506 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCLCP48506 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCLCP48506 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GCLCP48506 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCLCP48506 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GCLCP48506 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCLCP48506 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCLCP48506 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCLCP48506 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCLCP48506 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCLCP48506 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCLCP48506 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCLCP48506 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCLCP48506 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCLCP48506 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCLCP48506 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCLCP48506 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCLCP48506 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCLCP48506 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCLCP48506 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCLCP48506 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCLCP48506 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCLCP48506 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCLCP48506 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCLCP48506 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GCLCP48506 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCLCP48506 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GCLCP48506 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCLCP48506 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCLCP48506 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCLCP48506 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms