Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM4SF4P48230 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms