Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALDH1A3P47895 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms