Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRCC3P46736 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRCC3P46736 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRCC3P46736 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BRCC3P46736 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRCC3P46736 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRCC3P46736 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRCC3P46736 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRCC3P46736 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRCC3P46736 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRCC3P46736 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRCC3P46736 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRCC3P46736 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRCC3P46736 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRCC3P46736 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRCC3P46736 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRCC3P46736 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRCC3P46736 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRCC3P46736 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRCC3P46736 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRCC3P46736 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRCC3P46736 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRCC3P46736 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRCC3P46736 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRCC3P46736 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRCC3P46736 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRCC3P46736 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRCC3P46736 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRCC3P46736 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BRCC3P46736 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRCC3P46736 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRCC3P46736 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms